始建于1960年,坐落于厦门岛东南隅的万石山。全园占地4.93平方公里,是一个集植物物种保存、科学研究、科普教育、开发应用、生态保护、旅游服务等多功能于一体的综合性植物园。现已从世界各地引种栽培保育植物8600多种(含品种和种以下分类单位),建成棕榈植物区、多肉植物区、裸子植物区、奇趣植物区、姜目植物区、雨林世界等十几个专类园区,拥有国内目前规模最大的室外多肉植物展示区,是全国科普教育基地、中国生物多样性保护示范基地、全国野生动植物保护及自然保护区建设工程——棕榈植物保育中心。植物园植物景观、自然奇观与人文胜景相互交融,园区内风光旖旎、舒适宜人,是鼓浪屿——万石山国家重点风景名胜区的核心组成部分和国家首批AAAA级旅游景区。园内山峦起伏、奇岩趣石遍布,荟萃“万石涵翠”、“太平石笑”、“天界晓钟”、“万笏朝天”等厦门名景;坐拥天界寺、万石莲寺、太平岩寺等名刹古寺。邓小平、胡锦涛、习近平等党和国家领导人及一些国内外政要都曾来园视察、游览或植树纪念。1984年邓小平同志在南洋杉草坪内亲手种植了一株大叶樟,现已成为人们缅怀一代伟人的场所。